Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Acox2-204ENSMUST00000164598 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Btk-202ENSMUST00000113213 2121 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms