Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms