Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX43

Ankrd13c, Ankyrin repeat domain-containing protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd13cQ3UX43 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd13cQ3UX43 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms