Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms