Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clpsl2Q3UW21 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clpsl2Q3UW21 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clpsl2Q3UW21 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clpsl2Q3UW21 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clpsl2Q3UW21 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clpsl2Q3UW21 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clpsl2Q3UW21 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Clpsl2Q3UW21 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clpsl2Q3UW21 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clpsl2Q3UW21 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clpsl2Q3UW21 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Clpsl2Q3UW21 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clpsl2Q3UW21 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clpsl2Q3UW21 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clpsl2Q3UW21 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clpsl2Q3UW21 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Clpsl2Q3UW21 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clpsl2Q3UW21 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Clpsl2Q3UW21 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clpsl2Q3UW21 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clpsl2Q3UW21 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clpsl2Q3UW21 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clpsl2Q3UW21 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clpsl2Q3UW21 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clpsl2Q3UW21 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clpsl2Q3UW21 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clpsl2Q3UW21 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clpsl2Q3UW21 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clpsl2Q3UW21 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Clpsl2Q3UW21 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Clpsl2Q3UW21 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clpsl2Q3UW21 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clpsl2Q3UW21 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clpsl2Q3UW21 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms