Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms