Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms