Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR97

Snx21, Sorting nexin-21, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx21Q3UR97 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx21Q3UR97 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx21Q3UR97 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx21Q3UR97 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx21Q3UR97 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx21Q3UR97 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx21Q3UR97 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx21Q3UR97 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx21Q3UR97 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx21Q3UR97 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx21Q3UR97 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx21Q3UR97 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx21Q3UR97 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx21Q3UR97 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx21Q3UR97 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx21Q3UR97 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms