Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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Gm5460Q3UQ97 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm5460Q3UQ97 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5460Q3UQ97 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm5460Q3UQ97 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Gm5460Q3UQ97 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Gm5460Q3UQ97 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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