Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms