Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog7Q3UM29 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms