Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms