Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc61Q3UJV1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc61Q3UJV1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc61Q3UJV1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc61Q3UJV1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc61Q3UJV1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc61Q3UJV1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc61Q3UJV1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc61Q3UJV1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc61Q3UJV1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc61Q3UJV1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc61Q3UJV1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc61Q3UJV1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc61Q3UJV1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc61Q3UJV1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc61Q3UJV1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc61Q3UJV1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc61Q3UJV1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc61Q3UJV1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc61Q3UJV1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc61Q3UJV1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc61Q3UJV1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc61Q3UJV1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc61Q3UJV1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc61Q3UJV1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc61Q3UJV1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc61Q3UJV1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc61Q3UJV1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc61Q3UJV1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc61Q3UJV1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc61Q3UJV1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc61Q3UJV1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc61Q3UJV1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc61Q3UJV1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc61Q3UJV1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms