Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Edc4Q3UJB9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms