Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm648Q3UJ22 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gm648Q3UJ22 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gm648Q3UJ22 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gm648Q3UJ22 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gm648Q3UJ22 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gm648Q3UJ22 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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