Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkx6-3Q3UHX8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkx6-3Q3UHX8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkx6-3Q3UHX8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkx6-3Q3UHX8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkx6-3Q3UHX8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkx6-3Q3UHX8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkx6-3Q3UHX8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkx6-3Q3UHX8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nkx6-3Q3UHX8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nkx6-3Q3UHX8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkx6-3Q3UHX8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkx6-3Q3UHX8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Nkx6-3Q3UHX8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Nkx6-3Q3UHX8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkx6-3Q3UHX8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkx6-3Q3UHX8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nkx6-3Q3UHX8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms