Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms