Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zyg11bQ3UFS0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms