Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms