Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms