Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip13Q3UA06 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip13Q3UA06 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms