Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Cops9Q3U898 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cops9Q3U898 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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