Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
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Rnf180Q3U827 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf180Q3U827 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf180Q3U827 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf180Q3U827 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf180Q3U827 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf180Q3U827 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf180Q3U827 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf180Q3U827 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf180Q3U827 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf180Q3U827 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf180Q3U827 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf180Q3U827 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf180Q3U827 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf180Q3U827 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Rnf180Q3U827 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf180Q3U827 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf180Q3U827 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf180Q3U827 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Rnf180Q3U827 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Rnf180Q3U827 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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Rnf180Q3U827 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf180Q3U827 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf180Q3U827 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf180Q3U827 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf180Q3U827 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf180Q3U827 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf180Q3U827 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf180Q3U827 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf180Q3U827 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf180Q3U827 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf180Q3U827 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf180Q3U827 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf180Q3U827 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf180Q3U827 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf180Q3U827 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf180Q3U827 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf180Q3U827 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Rnf180Q3U827 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
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