Protein–RNA interactions for Protein: Q3U7U4

Transmembrane protein C1orf162 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U7U4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U7U4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U7U4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U7U4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U7U4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U7U4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U7U4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U7U4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U7U4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U7U4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U7U4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms