Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ssbp4Q3U4B1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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