Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3S3

Cenpl, Centromere protein L, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenplQ3U3S3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CenplQ3U3S3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms