Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

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Length 584 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Fam117bQ3U3E2 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Fam117bQ3U3E2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Fam117bQ3U3E2 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Fam117bQ3U3E2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Fam117bQ3U3E2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Fam117bQ3U3E2 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Fam117bQ3U3E2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Fam117bQ3U3E2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Fam117bQ3U3E2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Fam117bQ3U3E2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Fam117bQ3U3E2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Fam117bQ3U3E2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Fam117bQ3U3E2 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Fam117bQ3U3E2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Fam117bQ3U3E2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms