Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf40Q3U319 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf40Q3U319 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf40Q3U319 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Rnf40Q3U319 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf40Q3U319 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Rnf40Q3U319 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Rnf40Q3U319 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf40Q3U319 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Rnf40Q3U319 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Rnf40Q3U319 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf40Q3U319 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Rnf40Q3U319 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf40Q3U319 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf40Q3U319 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf40Q3U319 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf40Q3U319 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf40Q3U319 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf40Q3U319 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf40Q3U319 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf40Q3U319 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf40Q3U319 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf40Q3U319 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Rnf40Q3U319 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms