Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

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Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Kdm4dQ3U2K5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms