Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms