Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl4Q3TZA2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms