Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms