Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms