Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TTL0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TTL0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TTL0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TTL0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TTL0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TTL0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TTL0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TTL0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TTL0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms