Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms