Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrx1Q3TL44 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrx1Q3TL44 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrx1Q3TL44 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrx1Q3TL44 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrx1Q3TL44 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrx1Q3TL44 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrx1Q3TL44 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrx1Q3TL44 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrx1Q3TL44 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrx1Q3TL44 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrx1Q3TL44 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrx1Q3TL44 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrx1Q3TL44 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrx1Q3TL44 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrx1Q3TL44 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrx1Q3TL44 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrx1Q3TL44 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18■□□□□ 0.47
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Nlrx1Q3TL44 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18■□□□□ 0.47
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Nlrx1Q3TL44 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18■□□□□ 0.47
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Nlrx1Q3TL44 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrx1Q3TL44 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms