Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc13Q3TIR1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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