Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam107bQ3TGF2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms