Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Treml4Q3LRV9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Treml4Q3LRV9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Treml4Q3LRV9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Treml4Q3LRV9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Treml4Q3LRV9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Treml4Q3LRV9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Treml4Q3LRV9 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Treml4Q3LRV9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms