Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR3

Pdss2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss2Q33DR3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss2Q33DR3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss2Q33DR3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss2Q33DR3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss2Q33DR3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss2Q33DR3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss2Q33DR3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss2Q33DR3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss2Q33DR3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss2Q33DR3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss2Q33DR3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss2Q33DR3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdss2Q33DR3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms