Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms