Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nlrp1aQ2LKU9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp1aQ2LKU9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms