Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myo3bQ1EG27 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms