Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fam171bQ14CH0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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