Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
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Traf3ip1Q149C2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Traf3ip1Q149C2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms