Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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