Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Neurl1bQ0MW30 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Neurl1bQ0MW30 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms