Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms