Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q08AU9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q08AU9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Q08AU9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Q08AU9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Q08AU9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Q08AU9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q08AU9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q08AU9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q08AU9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q08AU9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q08AU9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q08AU9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q08AU9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q08AU9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q08AU9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q08AU9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q08AU9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q08AU9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q08AU9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q08AU9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q08AU9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q08AU9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q08AU9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q08AU9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q08AU9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q08AU9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q08AU9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q08AU9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q08AU9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q08AU9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q08AU9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q08AU9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q08AU9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q08AU9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q08AU9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q08AU9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q08AU9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q08AU9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q08AU9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q08AU9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q08AU9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q08AU9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q08AU9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q08AU9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q08AU9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q08AU9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q08AU9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q08AU9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q08AU9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q08AU9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q08AU9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q08AU9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q08AU9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q08AU9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q08AU9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q08AU9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q08AU9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q08AU9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q08AU9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q08AU9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q08AU9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q08AU9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q08AU9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q08AU9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q08AU9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q08AU9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q08AU9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q08AU9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q08AU9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q08AU9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q08AU9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q08AU9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q08AU9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q08AU9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q08AU9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q08AU9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q08AU9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Q08AU9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q08AU9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q08AU9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q08AU9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q08AU9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q08AU9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Q08AU9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q08AU9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q08AU9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q08AU9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Q08AU9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Q08AU9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q08AU9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q08AU9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q08AU9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q08AU9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q08AU9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q08AU9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q08AU9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q08AU9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q08AU9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q08AU9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms