Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms